Desde el arribo de Rodolfo Arruabarrena como entrenador a Boca Juniors, Nahuel Zárate no ha jugado un minuto en el primer equipo. El lateral ha sido uno de los más cuestionados en la época de Carlos Bianchi y con el “Vasco” solo se sentó en el banco de suplentes en tres ocasiones.
Debido a esto, el jugador esperaba tener un 2015 con rodaje, por lo que buscaba nuevos horizontes. Luego del interés de algunos equipos de Argentina, arregló ir a préstamo por un año a Godoy Cruz. En las próximas horas abandonará la pretemporada.
El mismo será sin opción de compra, por lo que retornará al Xeneize en 2016. En total vistió la camiseta en 33 oportunidades y nunca pudo anotar un gol.