A principios de 2013, Boca Juniors fichó a Juan Cruz Huichulef a Tristán Suárez. El defensor apenas contaba con algunos encuentros en el equipo que milita en la Primera B.
En el Xeneize tuvo bastante continuidad, incluso en el último campeonato de Reserva donde disputó 7 partidos.
Pese a esto, el jugador retornó a Tristán Suárez, a préstamo por un año.